机箱关机了主板还亮着影响吗

不影响。

如果确定是主板指示灯而非电源指示灯是可以关闭电源的。主板指示灯的作用：亮起表示主板在通电状态，以提醒用护更换内存或CPU以及显卡时记得先断掉外接电源，待主板指示灯熄灭后再行操作。以免损坏主板和其它部件。主板指示灯不管开机关机状态，只要电源插头没有拨掉都是亮着的。