1、構成不同:果實由果皮和果肉種子構成,果皮又可分爲外果皮、中果皮和內果皮。種子一般由種皮、胚和胚乳3部分組成,有的植物成熟的種子只有種皮和胚兩部分。
2、形成的器官不同:果實是被子植物的雌蕊經過傳粉受精,由子房或花的其他部分(如花托、萼片等)參與發育而成的器官。
種子是裸子植物和被子植物特有的繁殖體,它由胚珠經過傳粉受精形成。
3、形成條件不同:果實在自然條件下,有經傳粉受精而結實的,也有不經傳粉受精而結實的,這種果實沒有種子或種子不育,故稱無子果實(如無核蜜橘、香蕉)。
種子是胚珠必須經過傳粉受精才能形成種子。