微信店员通能看到支出吗

是看不到的，因为绑定店员收款，只是方便收款时候你接收通知，而你个人的支出，属于个人隐私，别人无法通过其他方式查看，除非你主动拿手机给对方查看。

现在微信号要求本人实名认证和银行卡绑定才可以使用二维码收款，如果是你的微信号绑定了店长，银行卡也就是店长本人了，所以收款自然也到店长账户里了。